MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 2018 chromosome

Total Repeats: 32294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017381	CAT	2	6	24	29	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017381	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017381	GAGC	2	8	72	79	25 %	0 %	50 %	25 %	385230890
4	NC_017381	CATT	2	8	158	165	25 %	50 %	0 %	25 %	385230890
5	NC_017381	GAT	3	9	166	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230890
6	NC_017381	TG	3	6	182	187	0 %	50 %	50 %	0 %	385230890
7	NC_017381	TTCT	2	8	303	310	0 %	75 %	0 %	25 %	385230890
8	NC_017381	GTT	2	6	349	354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230890
9	NC_017381	T	7	7	362	368	0 %	100 %	0 %	0 %	385230890
10	NC_017381	T	7	7	390	396	0 %	100 %	0 %	0 %	385230890
11	NC_017381	TTC	2	6	400	405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230890
12	NC_017381	ACA	2	6	426	431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385230890
13	NC_017381	C	6	6	444	449	0 %	0 %	0 %	100 %	385230890
14	NC_017381	AAT	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230891
15	NC_017381	C	6	6	686	691	0 %	0 %	0 %	100 %	385230891
16	NC_017381	TAA	2	6	694	699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230891
17	NC_017381	CT	3	6	735	740	0 %	50 %	0 %	50 %	385230891
18	NC_017381	CTT	2	6	844	849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230891
19	NC_017381	TGA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230891
20	NC_017381	AAAT	2	8	956	963	75 %	25 %	0 %	0 %	385230892
21	NC_017381	TG	3	6	1054	1059	0 %	50 %	50 %	0 %	385230892
22	NC_017381	AAC	2	6	1068	1073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385230892
23	NC_017381	CCGCAG	2	12	1087	1098	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385230892
24	NC_017381	CCA	2	6	1231	1236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385230892
25	NC_017381	GCT	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385230892
26	NC_017381	CA	3	6	1270	1275	50 %	0 %	0 %	50 %	385230892
27	NC_017381	T	6	6	1287	1292	0 %	100 %	0 %	0 %	385230892
28	NC_017381	T	6	6	1391	1396	0 %	100 %	0 %	0 %	385230892
29	NC_017381	GGC	2	6	1447	1452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385230892
30	NC_017381	GTT	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230892
31	NC_017381	TAG	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230892
32	NC_017381	CTT	2	6	1701	1706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230892
33	NC_017381	TTC	2	6	1806	1811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230893
34	NC_017381	A	7	7	1821	1827	100 %	0 %	0 %	0 %	385230893
35	NC_017381	ATTATA	2	12	1839	1850	50 %	50 %	0 %	0 %	385230893
36	NC_017381	CCTG	2	8	1854	1861	0 %	25 %	25 %	50 %	385230893
37	NC_017381	GCCA	2	8	1877	1884	25 %	0 %	25 %	50 %	385230893
38	NC_017381	TCA	2	6	1904	1909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230893
39	NC_017381	TGAA	2	8	1918	1925	50 %	25 %	25 %	0 %	385230893
40	NC_017381	GTT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230893
41	NC_017381	TTC	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230893
42	NC_017381	TGG	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230893
43	NC_017381	TCA	2	6	2095	2100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230893
44	NC_017381	AATG	2	8	2108	2115	50 %	25 %	25 %	0 %	385230893
45	NC_017381	AGG	2	6	2232	2237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385230893
46	NC_017381	GATTA	2	10	2292	2301	40 %	40 %	20 %	0 %	385230893
47	NC_017381	ATTC	2	8	2393	2400	25 %	50 %	0 %	25 %	385230893
48	NC_017381	TTC	2	6	2504	2509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017381	A	8	8	2586	2593	100 %	0 %	0 %	0 %	385230894
50	NC_017381	CTTT	2	8	2603	2610	0 %	75 %	0 %	25 %	385230894
51	NC_017381	T	7	7	2682	2688	0 %	100 %	0 %	0 %	385230894
52	NC_017381	TGA	2	6	2707	2712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230894
53	NC_017381	AGC	2	6	2822	2827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385230894
54	NC_017381	A	6	6	2873	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	385230894
55	NC_017381	AG	3	6	2992	2997	50 %	0 %	50 %	0 %	385230894
56	NC_017381	GTG	2	6	3011	3016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230894
57	NC_017381	T	6	6	3064	3069	0 %	100 %	0 %	0 %	385230894
58	NC_017381	AGA	2	6	3109	3114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230894
59	NC_017381	GTG	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230894
60	NC_017381	GCC	2	6	3177	3182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385230894
61	NC_017381	GAAA	2	8	3292	3299	75 %	0 %	25 %	0 %	385230895
62	NC_017381	GAAA	2	8	3367	3374	75 %	0 %	25 %	0 %	385230895
63	NC_017381	TG	3	6	3474	3479	0 %	50 %	50 %	0 %	385230895
64	NC_017381	GTT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230895
65	NC_017381	ATC	2	6	3707	3712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230895
66	NC_017381	AGAA	2	8	3823	3830	75 %	0 %	25 %	0 %	385230895
67	NC_017381	A	6	6	3861	3866	100 %	0 %	0 %	0 %	385230895
68	NC_017381	CAG	2	6	3869	3874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385230895
69	NC_017381	A	6	6	3911	3916	100 %	0 %	0 %	0 %	385230895
70	NC_017381	ATT	2	6	3951	3956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230895
71	NC_017381	TGT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230895
72	NC_017381	GGC	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385230895
73	NC_017381	GGT	2	6	4130	4135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017381	TAT	2	6	4178	4183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017381	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017381	TGG	2	6	4348	4353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017381	GTG	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017381	ACC	2	6	4492	4497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017381	GGT	2	6	4505	4510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017381	T	8	8	4646	4653	0 %	100 %	0 %	0 %	385230896
81	NC_017381	TAA	2	6	4852	4857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230897
82	NC_017381	TTA	2	6	4861	4866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230897
83	NC_017381	T	7	7	4878	4884	0 %	100 %	0 %	0 %	385230897
84	NC_017381	A	6	6	4889	4894	100 %	0 %	0 %	0 %	385230897
85	NC_017381	A	6	6	4905	4910	100 %	0 %	0 %	0 %	385230897
86	NC_017381	TGT	2	6	4944	4949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017381	TCATT	2	10	4955	4964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017381	GTTT	2	8	4967	4974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017381	C	6	6	5054	5059	0 %	0 %	0 %	100 %	385230898
90	NC_017381	AAG	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385230898
91	NC_017381	T	7	7	5071	5077	0 %	100 %	0 %	0 %	385230898
92	NC_017381	ACTA	2	8	5112	5119	50 %	25 %	0 %	25 %	385230898
93	NC_017381	ATC	2	6	5120	5125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017381	A	7	7	5163	5169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017381	A	6	6	5178	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	385230899
96	NC_017381	AAGA	2	8	5194	5201	75 %	0 %	25 %	0 %	385230899
97	NC_017381	A	6	6	5206	5211	100 %	0 %	0 %	0 %	385230899
98	NC_017381	A	7	7	5221	5227	100 %	0 %	0 %	0 %	385230899
99	NC_017381	CAAAA	2	10	5233	5242	80 %	0 %	0 %	20 %	385230899
100	NC_017381	C	6	6	5243	5248	0 %	0 %	0 %	100 %	385230899
101	NC_017381	A	8	8	5249	5256	100 %	0 %	0 %	0 %	385230899
102	NC_017381	A	6	6	5264	5269	100 %	0 %	0 %	0 %	385230899
103	NC_017381	A	8	8	5272	5279	100 %	0 %	0 %	0 %	385230899
104	NC_017381	A	9	9	5289	5297	100 %	0 %	0 %	0 %	385230899
105	NC_017381	AG	3	6	5309	5314	50 %	0 %	50 %	0 %	385230899
106	NC_017381	A	6	6	5318	5323	100 %	0 %	0 %	0 %	385230899
107	NC_017381	CAAAAA	2	12	5345	5356	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017381	C	7	7	5357	5363	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_017381	A	6	6	5364	5369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017381	A	6	6	5380	5385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017381	A	6	6	5396	5401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017381	A	6	6	5412	5417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017381	A	6	6	5427	5432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017381	AG	3	6	5445	5450	50 %	0 %	50 %	0 %	385230900
115	NC_017381	A	7	7	5457	5463	100 %	0 %	0 %	0 %	385230900
116	NC_017381	TCGC	2	8	5530	5537	0 %	25 %	25 %	50 %	385230900
117	NC_017381	CATT	2	8	5603	5610	25 %	50 %	0 %	25 %	385230900
118	NC_017381	ATT	2	6	5625	5630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230900
119	NC_017381	TGA	2	6	5738	5743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230900
120	NC_017381	CTT	2	6	5820	5825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385230901
121	NC_017381	T	6	6	5824	5829	0 %	100 %	0 %	0 %	385230901
122	NC_017381	GTT	2	6	5882	5887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
123	NC_017381	TAA	2	6	5951	5956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385230901
124	NC_017381	TTA	2	6	6009	6014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230901
125	NC_017381	GTG	2	6	6078	6083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385230901
126	NC_017381	GC	3	6	6140	6145	0 %	0 %	50 %	50 %	385230901
127	NC_017381	TGT	2	6	6199	6204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
128	NC_017381	GTT	2	6	6254	6259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
129	NC_017381	GCT	2	6	6303	6308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385230901
130	NC_017381	AGT	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385230901
131	NC_017381	TTGAT	2	10	6354	6363	20 %	60 %	20 %	0 %	385230901
132	NC_017381	GCTTGC	2	12	6384	6395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385230901
133	NC_017381	GCG	2	6	6457	6462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385230901
134	NC_017381	TTGCT	2	10	6471	6480	0 %	60 %	20 %	20 %	385230901
135	NC_017381	CGA	2	6	6508	6513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385230901
136	NC_017381	TCA	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385230901
137	NC_017381	TGT	2	6	6742	6747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
138	NC_017381	CTG	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385230901
139	NC_017381	CAC	2	6	6805	6810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385230901
140	NC_017381	TAT	3	9	6820	6828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385230901
141	NC_017381	GTTT	2	8	6831	6838	0 %	75 %	25 %	0 %	385230901
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149	NC_017381	GTT	2	6	7271	7276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385230901
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156	NC_017381	GTTT	2	8	7601	7608	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_017381	GA	3	6	19738	19743	50 %	0 %	50 %	0 %	385230914
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471	NC_017381	A	6	6	23236	23241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017381	TTTG	2	8	23243	23250	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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